УСТАНОВЛЕНИЕ ГЕНОТИПА. ФОРМА ОТЧЕТА.

По завершению оказания услуги установления генотипа одного образца, заказчику представляется отчет следующего вида:

 

Отчет №

 

Дата заказа

Дата получения образцов

Дата окончания исследования

Количество исследованных образцов: 1.

 

Метод выделения ДНК: EasiCollecttm.

Набор реагентов для генотипирования: Identifiler Plus PCR Amplification Kit (США).

Оборудование: генетический анализатор 310 Genetic analyzer

Программное обеспечение: Genemapper Software v 4.1

 

Результаты:

Локусы ДНК

Образец 1

D8S1179

10

14

D21S11

29

30

D7S820

9

10

CSF1PO

10

11

D3S1358

15

16

TH01

9

9,3

D13S317

9

12

D16S539

9

12

D2S1338

23

23

D19S433

14

15,2

vWA

15

16

TPOX

8

8

D18S51

14

17

Amelogenin

X

Y

D5S818

12

13

FGA

23

23

 

 

 

    Предоставленный отчет содержит данные о генетической карте заказчика.

    Такой анализ может быть интересен для людей, в силу своих профессиональных интересов находящихся в группе риска.

 

Исследование двух и более образцов

В том случае, когда оказывается услуга по установлению генотипа двух и более образцов, по каждому образцу представляется отдельный отчет. При этом у заказчика появляется возможность провести сравнение генотипов. Сравнение может быть необходимым при установлении происхождения биологических образцов (при постановке диагнозов по биопсийному материалу), а также при установлении прямого родства (родители-дети).

Отчет №

 

Дата заказа

Дата получения образцов

Дата окончания исследования

Количество исследованных образцов

 

Метод выделения ДНК: EasiCollecttm.

Набор реагентов для генотипирования: Identifiler Plus PCR Amplification Kit (США).

Оборудование: генетический анализатор 310 Genetic analyzer

Программное обеспечение: Genemapper Software v 4.1

 

Результаты:

Локусы ДНК

Аллель 1

Аллель 2

D3S1358

15

18

TH01

6

8

D21S11

29,2

32,2

 

Сравнение генотипов двух и более образцов.

В качестве примера приводится сравнение генотипов по трем участкам ДНК (локусам) трех образцов:

Каждый отчет содержит информацию о дате заказа, датах получения образцов и выполнения исследований, количестве исследованных образцов, методе выделения ДНК, используемых реагентах, оборудовании и программном обеспечении. Приводятся табличные данные об исследованных участках ДНК (локусах) и количестве повторов в исследуемых участках ДНК (аллелей), а так же графическое отображение данных, полученных при проведении исследования. Графические данные дублируются в таблице.

 

 Образец 1


Локусы ДНК

Аллель 1

Аллель 2

D3S1358

15

18

TH01

6

8

D21S11

29,2

32,2

 

Образец 2


Локусы ДНК

Аллель 1

Аллель 2

D3S1358

14

19

TH01

9

9,3

D21S11

30

32

 

Образец 3


Локусы ДНК

Аллель 1

Аллель 2

D3S1358

18

19

TH01

6

9,3

D21S11

30

32,2

 

На диаграмме в верхнем ряду в виде пиков представлены графические данные по трем локусам образца 1. Во втором и третьем ряду представлены графические данные по трем локусам образцов 2 и 3 соответственно.

Для локуса D3S1358 получены следующие генотипы: образец 1 – (15,18), образец 2 – (14,19), образец 3 – (18,19). Числовые обозначения аллелей соответствуют количеству содержащихся в них повторов. По локусу TH01 образец 1 – (6, 8), образец 2 – (9, 9.3), образец 3 – (69.3). По локусу D21S11 образец 1 – (29.2, 32.2), образец 2 – (30, 32), образец 3 – (3032.2).

При выполнении анализа по каждому локусу можно отметить совпадение аллелей у образцов 1 - 3 и 2-3, однако, совпадения аллелей 1-2 не отмечается.

В том случае, если совпадения аллелей будет наблюдаться минимум в 15 локусах из 16 анализируемых, то можно сделать вывод о наличии прямого родства (родители – дети) людей, предоставивших образцы 1 и 3, а также 2 и 3. Прямого родства между образцами 1 и 2 не отмечается в силу несовпадения аллелей.

На таком же принципе сравнения генотипов, например, основана процедура установления отцовства.